1.文件位置在:
C:\Users\用户名\AppData\Local\Packages\CanonicalGroupLimited.UbuntuonWindows_79rhkp1fndgsc\LocalState\rootfs
2.将路径加到其中:
echo "export PATH=/home/用户名/anaconda2/bin:$PATH" >> .bashrc
//发现之前安装,但是现在那些命令还是不会,所以总结一下。
转自:知乎Live孟浩巍-如何快速入门生物信息学
3.下载安装conda
wget https://........sh
wget是从这个地方下载,然后运行,
bash Anaconda2-.....sh
即可。
运行conda install fastqc即可安装fastqc软件。
4.关于apt
sudo apt install fastx-toolkit
使用了这个命令来安装,使用conda install fastx-toolkit一直安装不上。
这里的apt通常需要root权限,所以加上了sudo;
apt是linux中Advanced Packaging Tool高级包工具,是一个客户/服务器系统。
5.Linux中的执行权限是什么?
转自:https://zhidao.baidu.com/question/2011855285949862188.html
Linux的权限不是很细致,只有RWX三种
r(Read,读取):对文件而言,具有读取文件内容的权限;对目录来说,具有浏览目录的权限。
w(Write,写入):对文件而言,具有新增,修改,删除文件内容的权限;对目录来说,具有新建,删除,修改,移动目录内文件的权限。
x(eXecute,执行):对文件而言,具有执行文件的权限;对目录了来说该用户具有进入目录的权限。
1、目录的只读访问不允许使用cd进入目录,必须要有执行的权限才能进入。
2、只有执行权限只能进入目录,不能看到目录下的内容,要想看到目录下的文件名和目录名,需要可读权限。
3、一个文件能不能被删除,主要看该文件所在的目录对用户是否具有写权限,如果目录对用户没有写权限,则该目录下的所有文件都不能被删除,文件所有者除外
4、目录的w位不设置,即使你拥有目录中某文件的w权限也不能写该文件
6.touch命令
用touch修改某文件的时间戳到当前时刻。
用touch修改某文件的时间戳到任意时刻,要使用-t参数。
7.tar命令
转自:https://www.cnblogs.com/newcaoguo/p/5896975.html
-x解压,-j对bz2属性,-f后跟文件名
tar -xjf file.tar.bz2
解压这个文件。
-c是压缩成对应类型的文件:
tar -cf all.tar *.jpg
将所有.jpg的文件打成一个名为all.tar的包。-c是表示产生新的包,-f指定包的文件名。
8.Linux中删除文件某一行
转自:https://www.cnblogs.com/bymo/p/7991516.html
1、删除文档的第一行
sed -i '1d' <file>
4、删除文件中的第k行,例如k=3
sed -i '3d' <file>5、删除文件中包含某个关键字开头的所有行
sed -i '/^QWQ/d' <file>6、删除文件中包含某个关键字的所有行
sed -i '/QWQ/d' <file>9.指定显示文件中的行
https://www.cnblogs.com/shengulong/p/7892242.html
1、tail -n +/-数字 文件名 ——————显示文件尾几行
2、head -n 数字 文件名————————显示文件头几行